プレイ方法：
マップスクリーン上の、タップできる場所を選んでください。選択したキャラクターが現れたら、画面の端をタップし長押しして歩かせてください。赤いチャレンジアイコンでは、次のミッションを見ることができます。青いドアアイコンをタップすると教室に移動できます。チャレンジアイコンの付いたポニーをタップして話しかけることができます。ステージ選択画面が表示されたら、プレイ可能なステージのプレイボタンをタップすれば、ステージが開始されます。
ポケットポニーを装備する：
チャレンジ準備画面で、使用できるポニーを画面の上にあるスロットにドラッグ＆ドロップします。最大3匹のポニーを装備できます。ポニーが戦闘不能になると、装備できなくなります。戦闘不能になったポニーを回復させるには、ビッツを使うか、タイマーが0になるのを待てば無料で元に戻ります。いくつかのチャレンジでは、ポニーのレベル、カラー、レア度に制限があるため、特定のスロットに装備します。ポニーが条件を満たしていない場合は装備できません。装備できるポニーが最大数に達すると、3種類のブーストが表示されます。
ブースト：
ポケットポニーのステータスを強化させてチャレンジを進めるために、3種類のブーストを使用します。チャレンジをクリアすると、ポニーのステータスは元に戻ります。HPブーストは、ポニーのHPポイントを増やし、チャレンジの間より多くの攻撃に耐えることができます。パワーブーストは、敵への攻撃力を増やします。発射ブーストは、一度により多くの弾を発射できるようになります。ブーストを使うには、強化したいポケットポニーの上にドラッグ＆ドロップするだけです。チャレンジへの準備が整ったら、プレイボタンをタップしてください。
チャレンジ：
チャレンジは、上から敵がゲームボードに入り、1列かそれ以上の列に配置されて始まります。あなたのポケットポニーが倒される前に、すべての敵を倒すことがミッションです。装備されたポケットポニーはボードの下の方に現れます。ボードの中央をタップ＆長押ししてエイミングガイドを表示します。発射ラインを決め、指を離すと、敵をめがけてマジック弾が発射されます。敵のHPバーが完全に減ると、消滅します。敵がボードの下まで到達すると、一番近くのポニーに攻撃してきます。ポニーのHPバーがゼロになると、戦闘不能になり、攻撃できなくなります。他のポニーをタップして、代わりに使用します。敵のベースカラーと同じベースカラーのポニーを使用するのが秘訣です。そうすれば、敵により大きなダメージを与えることができ、同時にポニーが得る経験値も増えます。さらに、ポニーの特性パラメーターの一部が満たされます。
特性：
各ポケットポニーには異なった特性があります。全部で6つのカテゴリーがあり、それぞれ、ポニーのベースカラーで表されています：レッド（パワー/攻撃力が高い特性）、パープル（守り/一度かそれ以上の攻撃からポニーを守る特性）、オレンジ（ホールド/時間と敵の動きを止める特性）、ブルー（プッシュ/敵を上に動かして、味方の攻撃時間を増やす特性）、グリーン（毒/毒を盛り、敵を一時的に数秒間の間敵にダメージを与える特性）、ピンク（ヒール/1匹かそれ以上のポニーのHPポイントを回復する特性）。チャレンジの間、同じベースカラーの敵を倒したポニーの特性パラメーターは少しだけ溜まります。完全に溜まったら、ポニーの特性を解放するためにパラメーターをタップしてください。
ビッツ、XP、宝石:
チャレンジをクリアする度に、ゴールドビッツとXP（経験値）が贈られます。XPで、ポケットポニーのXPパラメーターが溜まります。XPパラメーターが一杯になると、レベルが上がります。レベルが上がると、以下の3つのステータスのいずれかが増えます：HP、パワー、発射。